Los nombres en la mayor parte de las
enzimas metabólicas se forman agregando el sufijo---asa al nombre de
sustratos, o a un término descriptivo de la reacción que catalizan. Por
ejemplo, la ureasa tiene a la urea como sustrato. La alcohol deshidrogenasa
cataliza la remoción de hidrogeno de los alcoholes (es decir, la oxidación de
alcoholes).
Unas pocas enzimas, como la tripsina y la
amilasa, se conocen por sus nombres históricos. Muchas enzimas recién
descubiertas recién su nombre de acuerdo con sus genes o de algunas
características no descriptivas. Por ejemplo, el nombre de Rec A se debe al gen
recA y el de HSP70 es de una proteína de choque producida por calor; ambas
enzimas catalizan la hidrolisis del ATP.
Un comité de la unión internacional de
Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB, de International Unión of Biochemistry
and Molecular Bilogy) mantiene un esquema de clasificación que asigna
categorías a las enzimas de acuerdo con las clase general de reacción química orgánica
que se cataliza. Las seis categorías son: oxidorreductasas, transferasas,
hidrolasas, liasas, isomerasas, y ligasas.
N de clase
|
Nombre de la clase
|
Tipo de reacción catalizada
|
1
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Oxidorreductasa
|
Transferencia
de electrones
|
2
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Transferasa
|
Transferencia
de grupos
|
3
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Hidrolasas
|
Reacción
con hidrolisis
|
4
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Liasas
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Dobles
enlaces, eliminación de grupos
|
5
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Isomerasa
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Grupos
de moléculas en formas isoméricas
|
6
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Ligasas
|
Formación
de enlaces-c mediante reacciones de condensación
|
|
|
|
1.
Las oxidorreductasas catalizan
las reacciones de oxidación-reducción. La mayor parte de esas enzimas se
llaman, en general, deshidrogenasas. También hay otras enzimas en esta clase
que se llaman oxidasas, per oxidasas, oxigenasas o reductasas. En bioquímica
hay cada vez más la tendencia a citar esas enzimas por su nombre formal, oxidorreductasas, y no por los nombres más
comunes en las publicaciones no muy recientes de bioquímica. Un ejemplo de una
oxidorreductasa es la lactato deshodrogenasa, llamada también lactato: NDA
oxidorreductasa. Esta enzima cataliza la conversión reversible de L-lactato en
piruvato. La oxidación de L-lactato se acopla a la reducción de la coenzima
nicotinamida adenina di nucleótido (NAD+).
2.
Las transferasas catalizan las
reacciones de transferencia de un grupo y pueden necesitar la presencia de
coenzima. En las reacciones de transferencia de grupo, una parte de la molécula
del sustrato se suele enlazar en forma covalente con la enzima o con su
coenzima. Este grupo incluye la cinasas, enzimas que catalizan la transferencia
de un grupo fosforillo de ATP. La alanina transaminasa, cuyo nombre sistemático
es L-alanina:2-oxiglutarato aminotransferasa.
3.
Las hidrolasas catalizan
hidrolisis. Son una clase especial de transfer asa donde el agua sirve como
aceptor del grupo transferido. La pirofosfatasa es un ejemplo sencillo de una
hidrolasa. En el nombre sistemático de esta enzima es disfosfato
fosfohidrolasa.
4.
La liasa catalizan la lisis de
un sustrato, al generar un enlace doble; son reacciones de eliminación, no
hidrolíticas y no oxidantes. En dirección inversa, las liasas catalizan la
adición de un sustrato a un doble enlace de un segundo sustrato. Una liasa que
cataliza una reacción de adición en las células es frecuentemente llamada
sintasa. La piruvato descarboxilasa pertenece a esta clase de enzimas ya que
descompone el piruvato en acetaldehído y dióxido de carbono. El nombre
sistemático de la piruvato descarboxilasa, 2-oxo-ácido carboxi-liasa casi nunca
se emplea.
l
5.
Las isomerasas catalizan
cambios estructurales dentro de una misma molécula (reacción de isomerización).
Como estas reacciones solo tienen un sustrato y un producto son de las
reacciones enzimáticas más simples. Las alanina recemasa es una isomerasa que
cataliza la interconversion de L-alanina y D-alanina. El nombre común es igual
al nombre sistemático.
6.
Las ligasas catalizan la
ligadura o unión de dos sustratos. Estas reacciones necesitan un suministro de
energía potencial química de un nucleósido trifosfato, como el ATP. Las ligasas
son usualmente llamadas sintetasas. La glutamina sintetasa, o
L-glutamato:amoniaco ligasa (formadora de ADP) usa la energía de la hidrolisis
del ATP para unir glutamato y amoniaco para producir glutamina.
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